Es werden überwiegend stochastische Modelle besprochen, mit denen die Genealogie von biologischen Sequenzen analysiert werden kann.

  • Grundlagen und Grundbegriffe der Evolution (Homologie, Rekombination, Wright-FisherModell)
  • Stochastische Modelle in der Evolution (Markowketten in stetiger Zeit, Jukes-CantorModell, GTR-Modell, Rates-across-Sites, Selektion)
  • Stammbaumrekonstruktionsverfahren – distanzbasierte Verfahren (Clustering) – Character-basierte Verfahren (Parsimony, Likelihood, Bayes)
  • Samplingmethoden im Tree Space (tree moves (NNI, SPR, TBR), Metropolis-HastingsAlgorithmus)

On request, the class can be taught in English.